草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿整体常用见的发病之中。肾企业中CaOx结晶体过饱合沉积物会转变成肾小管神经细胞破损和凋亡，根本在于转变成肾结石的转变成。短链脂肪的酸酸由肠内内水解酸化池真菌面团发酵伙食植物纤维存在，不光在整体肠内障壁中起反应，况且在整体程度上也起根本反应。中间，丁酸是最多种的短链脂肪的酸酸，有着消除炎症和免疫细胞调控反应,本理论研究探析丁酸对CaOx肾结石的反应和其意向靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山医院医生泌尿整形科吴忠博土生导师、周子健博土于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教学、周子健搏士在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱微生物与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了网药剂学学精准服务，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

好的文章名字：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 客企业单位：华山三甲医院 学习客体：大鼠、HK-2细胞系 组群信息：较组（Con）、绘图组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱带来了能力：网络数据药剂学学检则

思维工作流程表

实验数据

钻研工人一方面建立大鼠3d实体模型工具，依据人体生理血生化评价指标和组织安排疾病学刺绣等钻研科技手段出现 丁酸能能下降CaOx3d实体模型工具大鼠肾CaOx晶状体的成型和挤压伤，有所改善CaOx3d实体模型工具大鼠的宫颈炎症挤压伤和氧化的的有机化合物的过早形容。除此之外，丁酸还可调节草酸促进的HK-2神经元膜挤压伤、氧化的的应激反应和神经元膜凋亡。 为实验设计丁酸型式和靶dna微信系统信息，研发考生从PubChem抓取丁酸和丁酸酯的二维和三维图型式（图1A）。完成PharmMapper的统计数据显示库和Uniprot的统计数据显示库处置后共需求出115个丁酸靶dna供进1步概述。将dna所有导到STRING的统计数据显示库，实行PPI微信系统信息概述。Cytoscape提供了筛选的前20的联络线靶dna的详尽微信系统信息图，也包括CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。这部分联络线dna与微信系统信息中的某个dna均情况出肯定的涉及到的内容性，描述这部分dna几率引领着融合意义。GO和KEGG概述探求了丁酸联络线dna的涉及到的内容经由和微生物体学的功能（图1C）。联络线dna重点与类固醇刺的激素初次回复、腐蚀应激性现象初次回复、亲水性氧细胞系对类固醇刺的激素激励的现象并且对弱酸性普通机械产品的现象想关。以上所写，这部分联络线dna重点参与的了腐蚀应激性现象和对亲水性氧的微生物体现象的过程 ，是肾结石产生新机制中至关注重的经由，这表示丁酸几率在肾结石中引领注重意义。

图1| 丁酸的结构与靶人类基因互联网数据分析(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进两步挑战丁酸对CaOx肾结石事实上切靶dna，探讨技术职工采用GEO的服务器对GSE73680中建康参考与CaOx肾结石爱美者的dna不同确认了探讨。参考组与CaOx结石爱美者的明显性不同表明dna（DEGs）产前筛查标准的为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共建立到3783个dna造成明显改变，进来3379个（89.4%）dna表明上浮，404个（10.6%）dna表明调整（图2A）。对DEGs确认聚类分析法算法数据文件分析，热图呈现了前10个被选中DEGs的二维层次结构聚类分析法算法表现形式（图2B）。马上又，探讨技术职工确认GeneCards的服务器人力监定了370个已经与CaOx肾结石关于的的dna，综合排名前20位的預测dna十分关于的性评估就像文中2C如图是。是为了找见丁酸治疗方法CaOx肾结石的关键点靶点，探讨技术职工将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石关于的dna实现处理能够好几回个Venn图。终极，CYP2C9被确认为丁酸影响到CaOx肾结石的存在靶点(图2D)。于此，探讨技术职工还确认了丁酸与CYP2C9的大分子衔接，CYP2C9的四个碳水化合物残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸上下级的功效，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在进行网站药理学学預测CYP2C9是丁酸直接影响CaOx肾结石的靶dna后，理论研究人数还完成受损内部实验英文灵魂存在了CYP2C9可较低草酸引发的HK-2受损内部的ROS技术水平、支原体感染损坏和凋亡。

图2| 绝大多数据库聯合分折予测CYP2C9是丁酸能力于CaOx肾结石的靶基因组

研究方案效果

本学习首选发掘丁酸在身体和体内的均能调控CaOx肾结石实体模型的脱色应激状态反应和感染影向，然后经过网洛药学学筛分收获丁酸影向CaOx肾结石的自身靶点——CYP2C9，最好经过组织生殖细胞实践证明CYP2C9在草酸盐诱导型的HK-2组织生殖细胞ROS水准、感染影向和凋亡。这样发掘取决于丁酸或许经过调控CYP2C9来调控CaOx肾结石的脱色应激状态反应，调低感染影向。此的过程中拜谱生物学工程供给了网洛药学学枝术精准贴心服务，虽然拜谱生物学工程可从而提高熟进一步完善的基因组组学、蛋清质组学、分泌组学等几组学食品及枝术精准贴心服务，邀请致電了解和咨询！ 借鉴期刊论文：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.