
2023年9月26日,宁夏大学刘敦华教授团队在Food Chemistry(IF=8.8)上发表题为“TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration”的研究文章。研究人员利用TMT定量蛋白质组学共鉴定出377个差异表达蛋白(DEPs)。转铁蛋白、铁蛋白、谷胱甘肽过氧化物酶(GPX) 4和血红素加氧酶1等15种DEPs参与脂质过氧化、Fe2+ 和Fe3+ 转化、铁离子积累和线粒体氧化应激诱导铁死亡。此外,化学致癌物ROS、谷胱甘肽代谢、HIF-1和PPAR等信号通路可能通过影响游离铁过载和GPX4失活来促进铁凋亡。该研究成果中 拜谱菌物 为其提供 TMT血清组学 的检测与分析,发现的差异蛋白有助于拓展屠宰后牛肉储存过程中铁死亡的生理和分子机制的认识。
PART 01
分析数据
研发的人员科学探究随着事件的推移保鲜冷库事件提高至牛肉片片的坚硬程度标准、持水利、色彩、分离铁占比、ROS、脂质过氧化反应物、MDA、GSH和GPX4技术水平来监测肌肤组织性人体细胞核的铁死状况。最终现示,保鲜冷库事件提高至后,牛肉片片的坚硬程度标准在第六天和第6天重要性的大大减少;持水实力大大减少;颜色图片变深,逐渐耗尽油润,鲜橘红白色转变成暗橘红白色。不仅如此,分离铁、可溶性氧和MDA的占比重要性增强,人体细胞核凋亡率重要性增大。 探讨工作人员转化成的其他冷藏箱用时的健身全身肌肉试品的核苷酸质,那么使用SDS-PAGE研究,核苷酸质条带在的其他阶段生长透亮且同类(图1a)。选择核苷酸在的其他试品中的表达爱症状,研究感觉同组试品的中数字靠近于同程度(图1b),这说明健身全身肌肉试品核苷酸质兼有好的的组内同类性和组间不同之处性。 营养物质质组学共亲子签定出1996种营养物质质。以B0为差表组,淘汰B1、B2、B4和B6中的营养物质使用不一致性展示剖析,共亲子签定到376个DEPs。将火山图大数据可视化,并随之FC > 1.2、FC < 0.86和P < 0.05一个标准剖析DEP。报告单如下图1c-f下图,在B1/B0、B2/B0、B4/ B0和B6/B0中分刘海别亲子签定出22、33、73和140个DEPs,其中的分刘海别调整6、11、32和8九个,上涨16、22、41和56个。聚类分析办法测试了多种要在冷藏室保存过程腹肌组织化中营养物质质的展示,报告单出现腹肌营养物质展示不一致性随之储藏时的添加而添加(图1g)。
图1| 多种速冻时候的背部肌肉原材料蛋清质组学(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图2| 区别冷藏库時间的力量印刷品差别球蛋白探讨(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
表1 铁消失淀粉酶肽的PRM一定量分折(表源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 2023)
图3| 应用场景KEGG丰度差距表达方式血清的铁阵亡缘由(图源:Jun Liu, et al., FOOD CHEM., 202
PART 02、拜谱总结ppt
作者利用TMT定量蛋白质组学鉴定发现15个参与铁死亡调节的DEPs,包含铁离子运输、 Fe2+ 和 Fe3+转化、脂质氧化途径、氧化还原调节和含铁蛋白降解途径。铁死亡依赖于铁离子积累、GPX4失活和脂质过氧化。此外,通过对DEPs的蛋白质和途径相互作用分析,发现了37条代谢途径,通过调节细胞铁超载、细胞膜或细胞器膜脂质氧化和ROS积累来促进铁死亡。铁下垂机制的发现可能为提高牛肉冷藏品质的相关研究提供新的视角,可能有助于预测肉类的潜在质量和鉴定铁下垂的生物标志物。这一过程中拜谱生物工程提供了TMT降钙素原检测营养素质组学技能工艺提供贴心服务,拜谱生物工程已研究开发进行并加入了加强稳重的转录组学、营养素组学、代谢率组学相应几组学协同类产品技能工艺提供贴心服务安全体系,欢迎致电咨询!
参考选取专著:Liu J, Liu D, Hu Z, Hu Y, Yu X. TMT quantitative proteomics analysis reveals molecular mechanism of ferroptosis during beef refrigeration. Food Chem. 2023 Sep 26. doi: 10.1016/j.foodchem.2023.137596.